PDFpenPro to program do edycji plików PDF, który ma nieco więcej funkcjonalności od swojego "młodszego brata" - PDFpen. Umożliwia on dodatkowo tworzenie oraz edycję formularzy i spisu treści.

Najważniejsze możliwości edycji plików PDF:

• - dodawanie tekstów, grafik oraz podpisów,
• - przenoszenie, zmiana rozmiarów oraz usuwanie grafik,
• - podstawowe operacje na zeskanowanych dokumentach (przy użyciu OCR),
• - dodawanie, usuwanie oraz zmiana kolejności stron,
• - tworzenie oraz edycja formularzy,
• - tworzenie oraz edycja spisów treści,
• - kopiowanie tekstów z pliku,
• - dodawanie oraz drukowanie notatek/komentarzy,
• - automatyzacja edycji przy pomocy AppleScript,
• - zapis zedytowanych plików do formatu PDF.